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生物大分子晶體結(jié)構(gòu)的X-射線衍射分析技術(shù)簡介

2024-01-19 10:38:24信息公告33

生物分子晶體結(jié)構(gòu)的X-射線衍射剖析技術(shù)簡介(2014年說課版)結(jié)構(gòu)生物學結(jié)構(gòu)生物學()個體系統(tǒng)動態(tài)研究范疇臟器亞細胞結(jié)構(gòu)組織細胞一級結(jié)構(gòu)大分子運動高幀率結(jié)構(gòu)中、低碼率結(jié)構(gòu)AKN中級結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)生物學研究范疇結(jié)構(gòu)生物學()?研究對象是生物大分子及其復(fù)合物(蛋白質(zhì)、核酸、蛋白-小分子復(fù)合物、蛋白-蛋白復(fù)合物、蛋白-核苷酸復(fù)合物),小到生化小分子,大到整個內(nèi)質(zhì)網(wǎng)體或病毒粒子;?以生物大分子的三維結(jié)構(gòu)、運動(即構(gòu)型變化)和互相作用(如分子機器的結(jié)構(gòu)與功能)為研究內(nèi)容;?研究目的是:(1)揭示生物大分子發(fā)揮功能、自我調(diào)控和互相作用的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)/分子機制,回答生命科學基本問題;(2)借助三維結(jié)構(gòu)信息來整修生物大分子(如對酶的改建)或則小分子(如抗生素設(shè)計)。uH7物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

?多年來均為生物化學學乃至整個生物學研究的前沿領(lǐng)域結(jié)構(gòu)生物學研究中的諾貝爾獎(部份)CrickF和D在DNA分子的結(jié)構(gòu)研究(X-射線晶體學)上的貢獻而獲得了1962年諾貝爾生理學和醫(yī)學獎;M和J由于借助X-射線晶體學研究了肌紅蛋白的三維結(jié)構(gòu)而獲得了1962年諾貝爾物理獎;DC由于通過X-射線晶體學確定了一些重要生化物質(zhì)的結(jié)構(gòu)而獲得了1964年諾貝爾物理獎;KlugA由于在借助電子晶體學(電子顯微鏡學)測定生物物質(zhì)的結(jié)構(gòu)方面的貢獻而獲得了1982年諾貝爾物理獎;J、HuberR和H由于在解析光合作用中心的三維結(jié)構(gòu)(X-射線晶體學)上的貢獻而獲得了1988年諾貝爾物理獎;BoyerPD和JE因ATP生物合成的分子機制研究(X-射線晶體學、單分子)獲1997年諾貝爾物理獎;WüK由于發(fā)明了借助多維核磁共振技術(shù)測定氨水中生物大分子三維結(jié)構(gòu)的方式而獲得了2002年諾貝爾物理獎;R因為在細胞膜離子通道的結(jié)構(gòu)和機理研究方面的貢獻(X-射線晶體學、電子顯微鏡學)而獲得了2003年諾貝爾物理獎;RD由于在真核轉(zhuǎn)錄的分子基礎(chǔ)研究(X-射線晶體學)上的貢獻而獲得了2006年諾貝爾物理獎;V、TA和AE由于對內(nèi)質(zhì)網(wǎng)體的結(jié)構(gòu)(X-射線晶體學)、功能和機理研究獲得2009年諾貝爾物理獎;RJ、BK由于對G蛋白偶聯(lián)受體的研究(X-射線晶體學)獲得2012年度諾貝爾物理獎。uH7物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

2012年度諾貝爾物理獎:G蛋白偶聯(lián)受體研究(RJ,BK)J.BrianK.結(jié)構(gòu)生物學各分支簡介(結(jié)構(gòu)生物學研究方式)結(jié)構(gòu)生物學的分支學科二級結(jié)構(gòu)預(yù)測估算中級結(jié)構(gòu)預(yù)測研結(jié)究構(gòu)分子動力學模擬生物X-射線大分子晶體學學實電子顯微鏡學驗研多維核磁共振究單分子結(jié)構(gòu)生物學結(jié)構(gòu)生物學估算分支?靜態(tài)結(jié)構(gòu)預(yù)測(已知蛋白的多肽序列,預(yù)測其結(jié)構(gòu))1、初始模型的獲得基于同源蛋白結(jié)構(gòu)(同源建模)基于生物信息學的一些預(yù)測算法2、結(jié)構(gòu)的合理化立體物理原理、既往高精度的結(jié)構(gòu)測定數(shù)據(jù)牛頓熱學?結(jié)構(gòu)動態(tài)變化的模擬/預(yù)測(已知蛋白結(jié)構(gòu),預(yù)測其變化)1、初始模型的獲得實驗測定得到的高精度結(jié)構(gòu)預(yù)測得到的結(jié)構(gòu)2、分子運動(構(gòu)型變化)的模擬牛頓熱學量子熱學?結(jié)果的可靠性和對計算機運算能力的要求X-射線晶體學怎么測定生物大分子三維結(jié)構(gòu)?其基本原理:晶體結(jié)構(gòu)同它的衍射效應(yīng)之間存在著互為傅立葉()變換的關(guān)系∞∞∞1111?=,,2?++,,=??2(?++)=0=0=0?=?∞=?∞=?∞結(jié)晶克隆目的抒發(fā)目蛋白質(zhì)樣蛋白基因的蛋白品的純化衍射電鏡三維構(gòu)建技術(shù)怎么測定蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)?在電鏡下觀察生物大分午時,觀察的對象是三維結(jié)構(gòu),電鏡圖象是這種三維結(jié)構(gòu)的二維投影。uH7物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

由生物結(jié)構(gòu)的二維電鏡圖象推知其二維結(jié)構(gòu)的方式稱為三維構(gòu)建(three-)。Movieof核磁共振(NMR)技術(shù)怎么測定蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)??1950年,等人發(fā)覺:質(zhì)子共振頻度與其結(jié)構(gòu)(物理環(huán)境)有關(guān)。在高碼率下,吸收峰形成化學位移和裂分,由NMR圖譜可獲得質(zhì)子所處物理環(huán)境的信息以確定化合物結(jié)構(gòu)。?1971年,法國科學家J.提出二維核磁共振的概念,為解決生物大分子中質(zhì)子太多譜峰重疊嚴重的問題開發(fā)了思路。?1985年,KurtWü在此基礎(chǔ)上提出:以生物大分子中的質(zhì)子(氫原子核)作為檢測對象,測定所有空間上臨近的兩個質(zhì)子之間的距離和方位,這種數(shù)據(jù)加上物理鍵長等經(jīng)驗數(shù)據(jù)經(jīng)計算機處理后就可產(chǎn)生生物大分子的三維結(jié)構(gòu)模型。克隆目的抒發(fā)目的蛋白(常蛋白質(zhì)樣NMR數(shù)蛋白基因須要核素標記)品的純化據(jù)采集計算機依照實測原子空NOE指認(氫主、側(cè)鏈化寬度離信息和立體物理經(jīng)驗數(shù)據(jù)搭建分子結(jié)構(gòu)原子空間距離)學位移指認核磁共振(NMR)技術(shù)怎么測定蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)?臺灣理物理研究所的測定蛋白質(zhì)在氨水中的MHz核磁共振儀結(jié)構(gòu),因而可以在一定程度上反應(yīng)結(jié)構(gòu)的動態(tài)變化結(jié)構(gòu)生物學各研究方式的異同點方式優(yōu)點缺點發(fā)展省力、省錢結(jié)構(gòu)預(yù)測可效度、精度低,迄今尚需大力發(fā)理論預(yù)測為止仍不能用作功能研究的基礎(chǔ)展(1)直接闡明大分子動態(tài)變化的真(1)估算困難:估算量極大,須要尚需大力發(fā)實過程和圖景,精確解釋大分子高性能估算集群、超級計算機甚展分子動力學模擬的功能與調(diào)控至是特殊設(shè)計的超級計算機(2)可靠性和精度仍須要增強(1)結(jié)構(gòu)幀率可達極高(~0.5?)(1)須要培養(yǎng)晶體十分成熟,(2)所能測定的分子范圍極廣(2)在晶體分子的構(gòu)型被鎖定為一但仍在繼續(xù)X-射線晶體學(3)技術(shù)極為成熟定的狀態(tài)物理學分支圖譜,因而X-射線衍射技術(shù)建立(4)應(yīng)用成本較低無法直接捕捉到分子運動的充分信息(1)可以直接獲得分子的形貌信息(1)曾經(jīng)碼率低,近來有明顯提比較成熟,(2)適用于個別其他方式無法剖析高,已迫近晶體學較低水平!但仍須要發(fā)電子顯微鏡學NMR的樣品物理學分支圖譜,如無法結(jié)晶的膜蛋白,(2)樣品制備較難展大分子復(fù)合體等(3)無法研究比較小的分子(1)不須要晶體(1)所能測定的分子不能太大(一比較成熟,多維核磁共振(2)堿液狀態(tài)下測定,可以得到生般uH7物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

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