顯微鏡是一種精密的光學儀器光學顯微鏡的結構，已有300多年的發展史。自從有了顯微鏡，人們看見了過去看不到的許多微小生物和構成生物的基本單元——細胞。
哪些是光學顯微鏡：
光學顯微鏡是借助光學原理，把人眼所不能區分的微小物體放大成像，以供人們提取微細結構信息的光學儀器。
哪些是電子顯微鏡：
電子顯微鏡是以電子束為照明源，通過電子流對樣品的透射或反射及電磁透鏡的多級放大后在螢光屏上成像的小型儀器，而光學顯微鏡則是借助可見光照明，將微小物體產生放大影像的光學儀器。
光學顯微鏡與電子顯微鏡的區別：
概括上去，電鏡與光鏡主要有以下幾個方面的區別：
1.照明源不同。電子顯微鏡所用的照明源是電子槍發出的電子流；而光學顯微鏡的照明源是可見光(日光或燈光)，因為電子流的波長遠短于光波波長，故電鏡的放大及幀率明顯地低于光鏡。
2.透鏡不同。電子顯微鏡中起放大作用的目鏡是電磁透鏡(能在中央部位形成磁場的環型電磁線圈)；而光學顯微鏡的目鏡則是玻璃磨制而成的光學透鏡。電子顯微鏡中的電磁透鏡共有三組，分別與光鏡中聚光鏡、物鏡和物鏡的功能相當。
3.成像原理不同。在電子顯微鏡中，作用于被檢樣品的電子束經電磁透鏡放大后打到螢光屏上成像或作用于感光膠卷成像。其電子濃淡的差異形成的機理是，電子束作用于被檢樣品時，入射電子與物質的原子發生碰撞形成散射，因為樣品不同部位對電子有不同散射度，故樣品電子像以濃淡呈現；而光學顯微鏡中樣品的物像以色溫差呈現，它是由被檢樣品的不同結構吸收光線多少的不同所導致的。
4.所用標本制備方法不同，電子顯微鏡觀察所用組織細胞標本的制備程序較復雜，技術難度和費用都較高，在取材、固定、脫水和包埋等環節上須要特殊的試劑和操作，zui后還需將包埋好的組織塊放人纖薄切塊機劈成50～100nm厚的纖薄標本片；而光學顯微鏡觀察的標本則通常放在載玻片上，如普通組織切塊標本、細胞活檢標本、組織壓片標本和細胞滴片標本等。
目前，除了有能放大千余倍的光學顯微鏡，并且有放大幾十萬倍的電子顯微鏡光學顯微鏡的結構，使我們對生物體的生命活動規律有了更進一步的認識。在普通高中生物教學大綱中規定的實驗中，大部份要通過顯微鏡來完成，為此，顯微鏡性能的優劣是做好觀察實驗的關鍵。