西南學院數學系是理大學所屬的基層學術組織，下設理論化學、凝聚態化學、光學、無線電化學、物理實驗中心等科學研究與教學研究單位。
數學系現有數學學一級學科博士點，匯聚態化學學科是浙江省重點學科。化學系設有應用數學學?？茖I。按照專業建設和中學生就業須要，建立模塊化課群，實現學科、專業之間的交叉與融合，培養中學生具有扎實的數學理論基礎和利用物理及計算機技術解決實際問題的能力。
數學系現有教員工45人，其大專任班主任40人（院士10人，副院長19人，講師11人）東北林業大學物理實驗，實驗技術系列人員4人，工勤系列人員1人。班主任隊伍中，有國家級高水平人才1人，國家優秀青年基金獲得者1人，四川省百千萬人才工程4人?；瘜W系班主任積極從事化學及相關領域的科學研究工作，近年來在教學和科研方面取得若干標志性成果，諸如：主持國家自然科學基金18項、省廳級以上科研項目50余項，獲得多項科研和教學獎勵，包括1項山東省自然科學二等獎。
化學系承當了學院數學和學院化學實驗等?？粕Ｐ缘墓不A課。學院數學被評為國家級精品資源共享課程，學院數學（雙語）被評為國家級雙語示范課程，學院化學實驗被評為山東省精品課程東北林業大學物理實驗，化學實驗中心被評為山東省化學實驗教學示范中心。
據悉，化學系班主任近些年來積極舉辦對外學術交流，先后與法國、德國、英國、日本、加拿大等國家的學院和研究機構構建學術、科研和人才培養的交流關系。同時廣泛聘請國外、外著名學者為中學的兼職院士，并約請專家、學者進行學術交流。學術成果被包括諾貝爾獎得主的諸多國際頂級學者和國際合作組引用并正面評價。部份優秀學術成果還被評為年度世界十大數學學突破，以及被國際科學媒體平臺和網站公開報導。
化學學深刻改變了人們的宇宙觀，促使人類思想的革命性飛越，是基礎性推動學科且一直是高新技術發展的源泉和重要保障，不斷引起產業轉型，促使人類的現代文明和社會進步。西南學院化學系以人才支撐學科、以學科培養人才的方法，不斷提高自身的各項業務水平。嚴格把關人才培養質量、突出數學學科理學特色，并積極舉辦與文科學科在各個方向的交叉型學術合作和交流。同時，西南學院化學系也深刻認識到自身在社會服務方面所須承當的責任，積極配合山東省化學學會各項工作，借助空余時間開放專業實驗室，培訓和補習山東省內有潛質的學生的數學知識。最終目標是借助自身具備的科研教學條件為地區性社會經濟發展貢獻力量。