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分離細胞漿和細胞核蛋白全功略

更新時間:2023-10-26 文章作者:佚名 信息來源:網(wǎng)絡整理 閱讀次數(shù):

DXY網(wǎng)友問:本人核漿分離做了最少兩個月了吧,雖然沒有哪些進展細胞蛋白,我想請問高手賜教一下。我很想曉得我的配方有哪些問題,或則是我的操作有哪些須要注意的地方。非常謝謝!還有,我檢查的方式是用Ikb-α(標細胞質(zhì))和Oct-1(標細胞核),雖然抗原也不是挺好用。我做的是BT474細胞,cell。02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

我的方式如下:02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

1、用A漂洗02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

2、500G離心5分鐘02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

3、用+B(2:1)裂解細胞,輕輕混勻,孵育5-10分鐘02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

4、離心10分鐘(上清:細胞質(zhì)。沉淀:細胞核和細胞膜)02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

5、PBD漂洗細胞兩次,12000G離心10分鐘02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

6、C裂解細胞膜(裝入液氮中快速冷藏,在冰上熔化10分鐘)02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

7、離心10分鐘(上清:細胞核。沉淀:細胞膜)02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

8、用PBS漂洗02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

9、用PRPA在冰上放置30分鐘02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

10、12000G離心10分鐘(上清:細胞膜)02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

:10mmol/LHepes7.5;10mmol/Lkcl;1.5mmol/LMgcl2;0.5mmol/LDTT;1mmol/LNaF;1mmol/L;1/50ml02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

:+0.15%ofP-40;02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

:20mmol/LHepes7.5;420mmol/LNacl;1.5mmol/LMgcl2;0.5mmol/LDTT;1mmol/LNaF;1mmol/L;1/50ml02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

DXY網(wǎng)友回復:你是不是分離細胞漿蛋白和細胞核蛋白,之后做發(fā)覺細胞核中也有Ikb-α,或則細胞漿中也能測量到Oct-1啊?假如是或則細胞膜蛋白,我感覺挺正常的,由于轉錄因子部份也存在于細胞漿,至于Ikb-α是不是細胞質(zhì)特異性的我就不清楚了。并且,我認為你用的是試劑盒應當沒有問題的,但是也很難徹底分開,在步驟4汲取上清時當心點,不要觸碰沉淀,可以剩少許上清(這部份上清不搜集),之后用白尖再把這種上清吸干凈丟棄,這樣可以盡量降低各個組分的污染。我用過試劑盒分過細胞漿和細胞核蛋白,覺得挺好,起碼不影響實驗結果。假如,你想精確的徹底的分離,或則想得到Oct-1的話,建議你采用蔗糖梯度離心方式再度富集你搜集的各個組分上清,這可以分離得到比較純的你想要檢查的這些蛋白組分。02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

樓主問:謝謝賜教,我有如下幾個問題,謝謝回答02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

1、在實驗過程中,我搜集上清的時侯的確是搜集一部份,然而剩下的沒有棄下,上次改進。02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

2、對于我的抗原。Ikb-α是多克隆抗原,非特異性很強,覺得非常難做;OCT-1其實是單抗,但我基本上沒有檢查它應當?shù)拇笮。?0K左右),只是檢查到其它的分子量,不清楚為何,大約40多K吧!02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

3、我想請問您用試劑盒的療效不影響實驗是哪些意思?那那個牌子的試劑盒好用,還有,您檢查的方式跟我的抗原一樣嗎?02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

4、我的配方上面仍然是加好了DTT的,不現(xiàn)加現(xiàn)用有哪些后果嗎?02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

DXY網(wǎng)友回復:首先我做的抗原跟你不一樣,但我可以回答你的問題:02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

2.我用的大部份抗原多是多克隆抗原,也會有其他非特異性帶,而且不論如何目的帶總是最顯著的,基本上不會影響結果,但是我也發(fā)覺不同的來源的細胞用同一種抗原,有的就不會用其他非特異性帶,有的不管怎樣就會有非特點帶,有幾個方式可以盡量清除非特點帶,抗原的量少加一點,我抗原基本上都是1:1000以上,孵育過夜,二抗的量1:20000(上海中杉),故此可以降低上樣量,我通常50-75ug左右,這種前提抗原必須滴度高。02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

我在抗原上吃過很大的虧,買了兩家公司的抗原,都是進口有名的,都沒雜下來,后來用了第三家的,就很順利的做下來了。所以抗原很重要。所以,你首先得排除抗原的問題。我沒做過Ikb-α和OCT-1,所以不敢斷言你用的OCT抗原有問題,不顧第一次做,通常抗體量加多一定,先保證抗原能雜下來,接出來再做改善。02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

3.我指的是我用的試劑盒分離細胞漿細胞核組分,那它們?nèi)プ鑫业膶嶒灠ê虴MSA都能檢查目的蛋白。至于那個試劑盒好用,就不好說了。我用的是國產(chǎn)碧云天的。02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

4.通常情況下DTT都是另外配好凍-20度,用時加。但我在配細胞裂解液時就把所有的成份包括DTT配好了,之后分裝-20度保存。用時也沒發(fā)覺有哪些不妥的。所有,我認為應當沒有哪些大的影響。02c物理好資源網(wǎng)(原物理ok網(wǎng))

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